郓城历史悠久。商朝时期,为商王祖乙迁建都城之地,史称庇;春秋属鲁之西境,鲁成公四年(公元前587年)在此筑城名郓;南北朝时置清泽县,隋开皇十八年(598年)改名郓城县。历朝多为州县治所,明清时分属兖州和曹州府。1939年9月建立郓城县抗日县政府,先后属运西专署、鲁西二专署、冀鲁豫边区二专署、冀鲁豫八专署等。解放战争时期先后属冀鲁豫二专署、平原省菏泽专区。1952年11月30日平原省撤销,属山东省菏泽专区,1958年归济宁专区。1959—2002年,先后属菏泽专区、菏泽地区、菏泽市。